MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 105130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008380	GAAC	2	8	484	491	50 %	0 %	25 %	25 %	116249767
2	NC_008380	CATCTG	2	12	498	509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116249767
3	NC_008380	GA	3	6	526	531	50 %	0 %	50 %	0 %	116249767
4	NC_008380	CCG	2	6	541	546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249767
5	NC_008380	GC	3	6	548	553	0 %	0 %	50 %	50 %	116249767
6	NC_008380	AGC	2	6	619	624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249767
7	NC_008380	TGC	2	6	625	630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249767
8	NC_008380	CGAT	2	8	643	650	25 %	25 %	25 %	25 %	116249767
9	NC_008380	TGA	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249767
10	NC_008380	ATCT	2	8	777	784	25 %	50 %	0 %	25 %	116249767
11	NC_008380	GTCGG	2	10	802	811	0 %	20 %	60 %	20 %	116249767
12	NC_008380	TGA	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249767
13	NC_008380	CG	3	6	842	847	0 %	0 %	50 %	50 %	116249767
14	NC_008380	CGA	2	6	896	901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249767
15	NC_008380	ACG	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249767
16	NC_008380	ATC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249767
17	NC_008380	ATCT	2	8	963	970	25 %	50 %	0 %	25 %	116249767
18	NC_008380	CCA	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249767
19	NC_008380	CGC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249767
20	NC_008380	GAG	2	6	1173	1178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249767
21	NC_008380	CGC	2	6	1236	1241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249767
22	NC_008380	TCG	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249768
23	NC_008380	GGA	2	6	1508	1513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249768
24	NC_008380	CAG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249768
25	NC_008380	GGAGGG	2	12	1811	1822	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	116249768
26	NC_008380	ATT	2	6	1852	1857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249768
27	NC_008380	TGC	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249768
28	NC_008380	A	7	7	1892	1898	100 %	0 %	0 %	0 %	116249768
29	NC_008380	CGAT	2	8	1915	1922	25 %	25 %	25 %	25 %	116249768
30	NC_008380	TTCA	2	8	2080	2087	25 %	50 %	0 %	25 %	116249769
31	NC_008380	GGA	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249769
32	NC_008380	CGA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249769
33	NC_008380	TGA	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249769
34	NC_008380	CGT	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
35	NC_008380	CGG	2	6	2331	2336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249769
36	NC_008380	ATC	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249769
37	NC_008380	CGT	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
38	NC_008380	CG	4	8	2413	2420	0 %	0 %	50 %	50 %	116249769
39	NC_008380	CCGG	2	8	2461	2468	0 %	0 %	50 %	50 %	116249769
40	NC_008380	TCA	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249769
41	NC_008380	ACC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249769
42	NC_008380	CGT	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
43	NC_008380	TCG	2	6	2654	2659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
44	NC_008380	TCG	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249769
45	NC_008380	GC	4	8	2742	2749	0 %	0 %	50 %	50 %	116249769
46	NC_008380	TCA	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249769
47	NC_008380	CGC	2	6	2921	2926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249770
48	NC_008380	GCC	2	6	2974	2979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249770
49	NC_008380	GCTC	2	8	2981	2988	0 %	25 %	25 %	50 %	116249770
50	NC_008380	GTC	4	12	3150	3161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249770
51	NC_008380	GC	3	6	3198	3203	0 %	0 %	50 %	50 %	116249770
52	NC_008380	TC	3	6	3236	3241	0 %	50 %	0 %	50 %	116249770
53	NC_008380	ACG	2	6	3266	3271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249770
54	NC_008380	CGA	3	9	3310	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249770
55	NC_008380	TCG	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249770
56	NC_008380	ATC	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249771
57	NC_008380	AAC	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249771
58	NC_008380	CAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249771
59	NC_008380	CGG	2	6	3450	3455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249771
60	NC_008380	TCA	2	6	3503	3508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249771
61	NC_008380	AGC	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249771
62	NC_008380	CTT	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249771
63	NC_008380	TCA	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249771
64	NC_008380	CG	3	6	3687	3692	0 %	0 %	50 %	50 %	116249771
65	NC_008380	GGCGC	2	10	3744	3753	0 %	0 %	60 %	40 %	116249771
66	NC_008380	CGCAC	2	10	3815	3824	20 %	0 %	20 %	60 %	116249771
67	NC_008380	GC	3	6	3833	3838	0 %	0 %	50 %	50 %	116249771
68	NC_008380	GAT	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249771
69	NC_008380	CGG	2	6	3882	3887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249771
70	NC_008380	GGC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249771
71	NC_008380	GAC	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249771
72	NC_008380	GTG	2	6	3967	3972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249771
73	NC_008380	TGC	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249771
74	NC_008380	GAG	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249771
75	NC_008380	TCG	2	6	4049	4054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249771
76	NC_008380	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	116249771
77	NC_008380	TTC	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249772
78	NC_008380	ATC	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249772
79	NC_008380	GCG	2	6	4264	4269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249772
80	NC_008380	ACC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249772
81	NC_008380	GAT	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249772
82	NC_008380	GCA	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249772
83	NC_008380	CGC	2	6	4393	4398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249772
84	NC_008380	TCG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249772
85	NC_008380	TGT	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249772
86	NC_008380	TGCC	2	8	4769	4776	0 %	25 %	25 %	50 %	116249773
87	NC_008380	CT	3	6	4801	4806	0 %	50 %	0 %	50 %	116249773
88	NC_008380	TCC	3	9	4814	4822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249773
89	NC_008380	ACC	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249773
90	NC_008380	GGA	2	6	4879	4884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249773
91	NC_008380	GCC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249773
92	NC_008380	GAC	3	9	4903	4911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
93	NC_008380	CGCC	2	8	4927	4934	0 %	0 %	25 %	75 %	116249773
94	NC_008380	CGG	2	6	4951	4956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249773
95	NC_008380	AATGAG	2	12	4957	4968	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116249773
96	NC_008380	GAT	2	6	4975	4980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249773
97	NC_008380	AGC	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
98	NC_008380	GCCG	2	8	5033	5040	0 %	0 %	50 %	50 %	116249773
99	NC_008380	CAG	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
100	NC_008380	GCG	2	6	5089	5094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249773
101	NC_008380	GCA	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
102	NC_008380	CGA	4	12	5190	5201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
103	NC_008380	GCA	3	9	5223	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249773
104	NC_008380	CGATA	2	10	5385	5394	40 %	20 %	20 %	20 %	116249774
105	NC_008380	TCA	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249774
106	NC_008380	ATT	2	6	5417	5422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249774
107	NC_008380	GCTCC	2	10	5456	5465	0 %	20 %	20 %	60 %	116249774
108	NC_008380	GCC	2	6	5495	5500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
109	NC_008380	CGC	2	6	5515	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
110	NC_008380	GCC	2	6	5541	5546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
111	NC_008380	ACG	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249774
112	NC_008380	CGC	2	6	5609	5614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
113	NC_008380	CGC	2	6	5641	5646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249774
114	NC_008380	TGCG	2	8	5659	5666	0 %	25 %	50 %	25 %	116249774
115	NC_008380	GAT	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249774
116	NC_008380	GAA	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249774
117	NC_008380	GCG	2	6	5814	5819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249774
118	NC_008380	TCG	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249774
119	NC_008380	GCCA	2	8	5937	5944	25 %	0 %	25 %	50 %	116249774
120	NC_008380	ACG	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249774
121	NC_008380	CG	3	6	6049	6054	0 %	0 %	50 %	50 %	116249774
122	NC_008380	GAT	3	9	6157	6165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249775
123	NC_008380	CGG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249775
124	NC_008380	CGC	3	9	6276	6284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
125	NC_008380	GC	4	8	6316	6323	0 %	0 %	50 %	50 %	116249775
126	NC_008380	T	6	6	6324	6329	0 %	100 %	0 %	0 %	116249775
127	NC_008380	CGC	2	6	6358	6363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
128	NC_008380	ACG	2	6	6365	6370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249775
129	NC_008380	GATC	2	8	6474	6481	25 %	25 %	25 %	25 %	116249775
130	NC_008380	CCG	2	6	6500	6505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
131	NC_008380	CCG	2	6	6567	6572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249775
132	NC_008380	TCT	2	6	6641	6646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249775
133	NC_008380	TGC	2	6	6663	6668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249775
134	NC_008380	GGCC	2	8	6720	6727	0 %	0 %	50 %	50 %	116249775
135	NC_008380	GCT	2	6	6750	6755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249775
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255	NC_008380	CGAT	2	8	12424	12431	25 %	25 %	25 %	25 %	116249781
256	NC_008380	CGG	2	6	12439	12444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249781
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262	NC_008380	ATC	2	6	12622	12627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249781
263	NC_008380	GC	3	6	12734	12739	0 %	0 %	50 %	50 %	116249781
264	NC_008380	GCC	2	6	12745	12750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249781
265	NC_008380	CTA	2	6	12809	12814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249781
266	NC_008380	TCGA	2	8	12816	12823	25 %	25 %	25 %	25 %	116249781
267	NC_008380	CGA	2	6	12835	12840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249781
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270	NC_008380	ATT	2	6	13263	13268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249782
271	NC_008380	TGC	2	6	13276	13281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249782
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275	NC_008380	ATC	2	6	13364	13369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249782
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291	NC_008380	CGC	2	6	14369	14374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249783
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295	NC_008380	CGA	2	6	14537	14542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249783
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341	NC_008380	CGA	2	6	16507	16512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249785
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369	NC_008380	CGG	3	9	18368	18376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249787
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373	NC_008380	CGA	2	6	18467	18472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249787
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375	NC_008380	ACCT	2	8	18525	18532	25 %	25 %	0 %	50 %	116249787
376	NC_008380	AAGG	2	8	18558	18565	50 %	0 %	50 %	0 %	116249787
377	NC_008380	CAT	2	6	18707	18712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249787
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381	NC_008380	CGCA	2	8	18869	18876	25 %	0 %	25 %	50 %	116249788
382	NC_008380	GCG	2	6	18940	18945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249788
383	NC_008380	CTCG	2	8	18962	18969	0 %	25 %	25 %	50 %	116249788
384	NC_008380	CAT	2	6	18971	18976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249788
385	NC_008380	AGGC	2	8	18991	18998	25 %	0 %	50 %	25 %	116249788
386	NC_008380	CAT	2	6	19004	19009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249788
387	NC_008380	TCCGA	2	10	19029	19038	20 %	20 %	20 %	40 %	116249788
388	NC_008380	GGCC	2	8	19064	19071	0 %	0 %	50 %	50 %	116249788
389	NC_008380	GC	4	8	19073	19080	0 %	0 %	50 %	50 %	116249788
390	NC_008380	GGC	2	6	19086	19091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249788
391	NC_008380	GAA	2	6	19100	19105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249788
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393	NC_008380	TGA	2	6	19159	19164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249788
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399	NC_008380	CTA	2	6	19388	19393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249788
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404	NC_008380	CGT	3	9	19553	19561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249788
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500	NC_008380	CGG	2	6	24038	24043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792

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